Возможно уже существует такая настройка, чтобы письма попадающие, к примеру, в папку Спам, вследствии фильтрации почтового веб-сервиса; при загрузке в The Bat! сразу помечались как прочитанные. Если такой готовой настройки нет, то её желательно добавить в программу.
Спасибо.